Proteómica
Presentación
La proteómica se ha posicionado como en herramienta esencial en la investigación biomédica al ofrecer un enfoque sistemático para desentrañar las complejidades del proteoma, el conjunto completo de proteínas de un sistema biológico. Empleando técnicas como la espectrometría de masas, la proteómica permite a los investigadores profundizar en la dinámica estructural, funcional y de interacción de las proteínas.
En el ámbito de la investigación sanitaria, la proteómica desempeña un papel fundamental en el avance de nuestra comprensión de las enfermedades. Mediante la identificación y cuantificación de proteínas, los investigadores pueden discernir firmas moleculares indicativas de diversas condiciones patológicas. Esta información no sólo ayuda a descubrir biomarcadores, sino que también allana el camino para intervenciones terapéuticas específicas y el desarrollo de herramientas de diagnóstico.
Los conocimientos obtenidos mediante la proteómica basada en la espectrometría de masas contribuyen no sólo a descifrar las funciones celulares normales, sino también a desvelar las aberraciones asociadas a las enfermedades. Estos conocimientos constituyen la base de estrategias de tratamiento innovadoras, de la medicina personalizada y de la identificación de nuevas dianas terapéuticas.
La plataforma de Proteómica del Instituto Biobizkaia está integrada dentro de las plataformas y servicios de apoyo a la investigación. La principal misión de la Plataforma de Proteómica es el desarrollo y la implementación de estrategias experimentales basadas en la proteómica que permitan resolver los problemas biomédicos de los investigadores. Para ello, la Plataforma proporciona asesoramiento experto en las distintas cuestiones relacionados con el diseño y la ejecución de un experimento de proteómica. Concretamente, la Plataforma de Proteómica lleva a cabo todas las fases del experimento, incluyendo la preparación de muestras, el análisis mediante espectrometría de masas y el procesamiento de los datos. Para ello, la Plataforma cuenta con personal técnico y científico con una gran experiencia en el campo. En lo que a infraestructuras se refiere, la Plataforma cuenta con dos espectrómetros de masas de última generación que permiten analizar muestras de una elevada complejidad con unos altos niveles de sensibilidad.
Descripción general
La proteómica se ha posicionado como en herramienta esencial en la investigación biomédica al ofrecer un enfoque sistemático para desentrañar las complejidades del proteoma, el conjunto completo de proteínas de un sistema biológico. Empleando técnicas como la espectrometría de masas, la proteómica permite a los investigadores profundizar en la dinámica estructural, funcional y de interacción de las proteínas.
En el ámbito de la investigación sanitaria, la proteómica desempeña un papel fundamental en el avance de nuestra comprensión de las enfermedades. Mediante la identificación y cuantificación de proteínas, los investigadores pueden discernir firmas moleculares indicativas de diversas condiciones patológicas. Esta información no sólo ayuda a descubrir biomarcadores, sino que también allana el camino para intervenciones terapéuticas específicas y el desarrollo de herramientas de diagnóstico.
Los conocimientos obtenidos mediante la proteómica basada en la espectrometría de masas contribuyen no sólo a descifrar las funciones celulares normales, sino también a desvelar las aberraciones asociadas a las enfermedades. Estos conocimientos constituyen la base de estrategias de tratamiento innovadoras, de la medicina personalizada y de la identificación de nuevas dianas terapéuticas.
La plataforma de Proteómica del Instituto Biobizkaia está integrada dentro de las plataformas y servicios de apoyo a la investigación. La principal misión de la Plataforma de Proteómica es el desarrollo y la implementación de estrategias experimentales basadas en la proteómica que permitan resolver los problemas biomédicos de los investigadores. Para ello, la Plataforma proporciona asesoramiento experto en las distintas cuestiones relacionados con el diseño y la ejecución de un experimento de proteómica. Concretamente, la Plataforma de Proteómica lleva a cabo todas las fases del experimento, incluyendo la preparación de muestras, el análisis mediante espectrometría de masas y el procesamiento de los datos. Para ello, la Plataforma cuenta con personal técnico y científico con una gran experiencia en el campo. En lo que a infraestructuras se refiere, la Plataforma cuenta con dos espectrómetros de masas de última generación que permiten analizar muestras de una elevada complejidad con unos altos niveles de sensibilidad.
Servicios
Servicios ofrecidos
La Plataforma de Proteómica posee una gran experiencia en la mayor parte de flujos de trabajo necesarios para el análisis de muestras biológicas. Se recomienda contactar con el personal de la Plataforma quienes asesorarán sobre las técnicas y estrategias más adecuadas para cada experimento/necesidad. Entre las técnicas y servicios ofertados se incluyen los siguientes:
- Digestión de proteínas mediante estrategias en solución FASP, iST, SP3...
- Identificación de proteínas a partir de bandas de un gel de acrilamida.
- Identificación y cuantificación de proteínas/proteomas en muestras líneas celulares.
- Identificación y cuantificación de proteínas/proteomas a partir de tejidos congelados y parafinados.
- Identificación y cuantificación de proteínas secretadas (secretoma).
- Cuantificación de proteínas/proteomas mediante label-free.
- Cuantificación de proteínas/proteomas mediante marcaje isobárico (TMTpro 18plex).
- Cuantificación de proteínas/proteomas mediante marcaje metabólico (SILAC).
- Análisis de muestras mediante DDA y DIA.
- Análisis de muestras mediante proteómica dirigida PRM.
- Identificación de modificaciones post-traduccionales:
- Fosforilación, mediante IMAC/TiO2.
- Ubiquitinación, Acetilación, Metilación…mediante anticuerpos pan-específicos.
- Identificación de interacciones de proteínas (endógenas, mediante tags…).
- Identificación de biomarcadores en muestras de biofluidos (suero, orina…).
- Identificación de proteínas en vesículas extracelulares (en células en cultivo y biofluidos).
- Análisis estadísticos (expresión diferencial).
- Análisis funcionales (enriquecimiento de Gene Ontology, GSEA…).
- Integración con otros datos ómicos (RNAseq, multiómicas).
Aplicaciones
Infraestructuras
En la actualidad, la plataforma dispone de estas tecnologías e infraestructuras:
Dos espectrómetros de masas Exploris 480 (Thermo Fisher).
Dos sistemas de nano-UHPLC Vanquish Neo (Thermo Fisher).
Estación de trabajo de altas prestaciones (Lenovo).
Integrantes de la plataforma
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Javier Muñóz Peralta
Responsable
javier.munozperalta@bio-bizkaia.eus
Proteómica
846439 | 946006439
Edificio Biocruces Bizkaia 1 | Cruces, Bizkaia
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María Sendino Mouliet
maria.sendinomouliet@bio-bizkaia.eus
Proteómica
Edificio Biocruces Bizkaia 1 | Cruces, Bizkaia
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